ПЦР тестирование состава микробиоты кишечника. Биоценоз

Микробиота кишечника участвует в процессах пищеварения, детоксикации, в работе иммунной и нервной систем и во многих других процессах жизнедеятельности организма. В составе микробиоты кишечника огромное количество микроорганизмов. Есть абсолютно «хорошие, безусловно полезные», например бифидобактерии и лактобактерии. Но есть и абсолютно вредные, которые всегда вызывают болезни — клостридии, сальмонеллы, шигеллы. Живут также в кишечнике условно-патогенные бактерии, которые стараются вести «тихо», но при ослаблении иммунной защиты, при отравлениях и других экстремальных ситуациях становятся патогенными, вызывают болезни не только в ЖКТ но и в других органах (почки, легкие и др.).Поэтому точная оценка состава микробиоты кишечника необходима не только для уточнения диагноза, но и для выбора оптимальной программы лечения, питания и реабилитации с применением пробиотиков, для контроля результатов лечения и реабилитации.

В нашей практике мы используем метод диагностики «Микрофлора человека» биоценоз — персональный ПЦР тест, направленный на выявление нормобионтов и патобионтов, формирующих биоценоз кишечника.

Тест позволяет оценить состояние микрофлоры кишечника по 24 показателям (нормофлора, микроорганизмы-маркёры заболеваний):

• количество и соотношение 7 полезных бактерий;
• 9 условно-патогенных и болезнетворных микроорганизмов;
• 3 абсолютно патогенных микроорганизма, возбудителя острых кишечных инфекций;
• 3 маркера, связанные с различными патологическими состояниями;
• индекс избыточного бактериального роста и анаэробного дисбаланса.

Применение метода ПЦР позволяет расширить спектр выявляемых микроорганизмов, в частности, метод значительно эффективнее, чем бактериологический, в определении таких важных для клиницистов представителей анаэробной флоры, как Clostridium difficile и Faecalibacterium prausnitzii, энтероинвазивные свойства E. coli. В состав комплекса входят микробиологические маркеры рака прямой кишки (Fusobacterium nucleatum, Parvimonas micra), которые позволяют на ранних сроках идентифицировать предраковые состояния эпителия и купировать развитие заболевания.

К основным преимуществам метода стоит отнести эффективность в обнаружении сложнокультивируемых анаэробных бактерий. Это особенно важно для выявления патогенных видов клостридий (Clostridium difficile, Clostridium perfringens), а также для количественной оценки таких важных представителей нормофлоры как бутират-продуцирующие микроорганизмы (например, Faecalibacterium prauznitzii) и оценки степени анаэробного дисбаланса (соотношение Bacteroides fragilis / Faecalibacterium prausnitzii).

Метод ПЦР в реальном времени позволяет выявить:

• снижение содержания облигатных представителей микробиоценоза (бифидобактерий и /или лактобацилл) как результат длительной и /или нерациональной антибиотикотерапии;
• наличие в диагностически значимых количествах (> 10×4) представителей условно-патогенной флоры (Klebsiella spp., Proteus spp., Staphylococcus aureus, Clostridium diffi cile и др.);
• изменение соотношения популяций микроорганизмов (снижение общего числа продуцентов бутирата при нормальном количестве бактероидов, а также значительное увеличение E. coli, часто с генами патогенности, являются информативными диагностическими и прогностическими признаками при воспалительных заболеваниях кишечника).

Количественная ПЦР — это способ размножения in vitro конкретного участка любого гена (например — 16S РНК). Запуск этой цепной реакции происходит с помощью геноспецифических цепочек (праймеров), а добавление специфического флюоресцентного зонда позволяет подсчитать количество генокопий данного микроба в образце. Преимущества: метод — достаточно точный и быстрый, дает количественную оценку числа генокопий бактерий, независимо от их жизнеспособности.

Результаты исследования позволят правильно подобрать для Вас необходимый комплекс препаратов для лечения и корректировки отклонений показателей микробиоты кишечника от нормы, необходимые диетические рекомендации.

В каких случаях необходимо провести тест «Микрофлора человека» биоценоз:

• постоянные или периодические приступы диареи, запоры невыясненной этиологии, чередование этих состояний;
• существенное изменение структуры каловых масс;
• метеоризм, отрыжка, вздутие живота;
• неприятный запах изо рта, металлический привкус во рту, тошнота, рвота;
• нарушение аппетита;
• ноющие или тупые регулярные боли в животе неясной этиологии;
• заболевания ЖКТ (гастриты, дуодениты, язвенная болезнь желудка и двенадцатиперстной кишки, болезнь Крона, неспецифический язвенный колит, синдром раздраженного кишечника);
• метаболические нарушения (ожирение, диабет 2-ого типа);
• снижение иммунитета и неспецифические аллергические реакции;
• кожные высыпания и зуд невыясненной этиологии;
• слабость и быстрая утомляемость;
• лечение нестероидными противовоспалительными препаратами;
• длительный прием антибиотиков;
• длительная гормонотерапия;
• проведение химио- и лучевой терапии у онкологических больных;
• профилактика возрастных изменений микробиоты кишечника.